インボイス制度とは

インボイス制度とは、消費税の仕入税額控除のしくみのことで、正式名称を「適格請求書等保存方式」といいます。売り手が適格請求書（インボイス）を発行し、買い手がこれを保存することで、消費税率と消費税額の認識を一致させる制度です。

適格請求書（インボイス）の発行には、納税地を所轄する税務署長への登録申請が必要です。登録を受けた「適格請求書発行事業者」のみが適格請求書（インボイス）を交付できます。

適格請求書（インボイス）では、品目ごとに適用される消費税率や税率区分ごとの合計額、各区分に対応した消費税額を明記する必要があります。これらの記載事項を満たした適格請求書（インボイス）が交付されることで、仕入税額控除の適用が可能となります。

インボイス制度の7つの問題点

インボイス制度の導入により、中小事業者にさまざまな影響が生じています。特に、経理業務の複雑化や免税事業者への税負担増加など、実務上の課題が浮き彫りになっている状況です。
ここでは、インボイス制度が抱える主な7つの問題点について、わかりやすく解説します。

経理・事務負担の増加

インボイス制度の導入により、経理担当者の業務負担が大幅に増加しています。適格請求書（インボイス）には記載項目が多く、請求書だけでなく領収書や納品書など取引を証明するすべての書類について、登録番号の確認や税率区分ごとの計算が必要です。

さらに、2024年1月施行の電子帳簿保存法により、電子データで受領した書類は電子保存が義務化されたため、データ保存のルール策定や社内教育、情報セキュリティ対策も求められます。適格請求書（インボイス）とそれ以外を区別した処理フローの構築や、取引先ごとの登録状況管理など、バックオフィス業務全体の複雑化が避けられない状況です。

免税事業者への影響

免税事業者は適格請求書（インボイス）を発行できないため、取引先である課税事業者は仕入税額控除を受けられず、消費税負担が増加します。その結果、契約の打ち切りや報酬の減額を要請されるリスクが高まっているのが現状です。

免税事業者から課税事業者へ転換すれば取引の維持は見込めるでしょう。しかし、これまで免除されていた消費税の納税義務が発生し、新たな負担が生じます。

免税事業者は既存取引先との関係維持や新規顧客獲得への影響を考慮し、課税事業者への転換を含めた早期の対応や検討が必要となるでしょう。なおインボイス制度導入の経過措置として、一定期間は仕入税額相当額の控除が認められています。

消費税負担が増加する可能性がある

インボイス未登録の事業者から商品やサービスを仕入れた場合、買い手側の課税事業者は仕入税額控除を受けられず、消費税負担が増加します。通常、事業者は売上時に預かった消費税から、仕入れ時に支払った消費税を差し引いて納税しますが、適格請求書（インボイス）がなければこの控除が認められません。
結果、仕入れ時に支払った消費税分を自社で負担することになり、実質的なコスト増加につながります。

ただし、急激な負担増を緩和するため、2029年9月30日（日）までは経過措置が設けられており、一定割合の仕入税額控除が認められています。課税事業者は、取引先の登録状況を確認し、経過措置を活用しながら適切な対応を検討する必要があるでしょう。

価格や取引条件の不透明化

インボイス制度の導入に伴い、免税事業者・課税事業者を問わず、価格転嫁や報酬交渉の複雑化、取引条件の不透明化といった問題が起こりやすくなっています。特に交渉力が弱い小規模事業者は、不利な条件でも受け入れざるを得ない状況に陥りやすく、実質的な収入の減少につながるリスクがあります。
このような取引環境の変化は、制度導入によって生じた市場全体の構造的な課題と言えるでしょう。

コストの負担

企業のインボイス制度対応には、システム改修や新規導入が必要となるケースが多く、大きなコスト負担がかかります。適格請求書（インボイス）の記載要件を満たす請求書発行システムへ更新したり、受領した請求書の登録番号照合・仕入税額控除の自動計算機能を備えた会計システムを導入したりなど、売り手・買い手の双方でシステム対応が必要です。

特に中小企業にとっては、初期費用や従業員への研修費用・運用コストなどが継続的な負担となる可能性があります。企業規模や取引量に応じた適切なシステム選定が重要となるでしょう。

物価高騰への波及

インボイス制度の導入による売上減少を避けるため、免税事業者から課税事業者へと転換した事業者が、新たに発生する消費税の納税負担を商品やサービスの価格に転嫁せざるを得ないケースもあります。また、システム導入や事務負担増加に伴うコストも、最終的には価格へ反映される可能性があるため、これらが物価上昇の一因となることが懸念されています。

このような価格転嫁は、消費者の購買負担増加だけでなく、取引先事業者のコスト増にもつながるでしょう。特にフリーランスが多く活躍する業界では、制度対応の負担から廃業を選択するケースも見られ、産業全体への影響も危惧されています。インボイス制度は、個々の事業者の問題にとどまらず、日本経済全体に波及する可能性があるのです。

情報公開によるリスク

適格請求書発行事業者として登録すると、国税庁の「適格請求書発行事業者公表サイト」に氏名や登録番号などの情報が公表されます。個人事業主の場合、住所の公表は任意ですが、氏名や登録年月日は必ず公表されるため、プライバシーへの懸念があります。

公表された情報は誰でも閲覧可能で、営利目的での商用利用も認められているため、執拗な営業活動を受けるリスクや、副業が会社に知られる可能性もあるでしょう。
対策として、媒介者交付特例の活用や住所非公表など、情報管理とセキュリティ面への意識が必要となります。

インボイス制度のメリット

インボイス制度には問題点がある一方、事業者にとってメリットもあります。適格請求書（インボイス）の導入により消費税率と税額の透明性が高まり、正確な税務処理が可能になります。また、システム導入による業務効率化や、適格請求書発行事業者としての信頼性向上により、新たな取引機会の創出も期待できます。

ここでは、インボイス制度がもたらす主なメリットについて解説します。

正しい税率を把握

軽減税率により消費税率は8％と10％が混在する状況となり、企業の税務処理は複雑化していました。しかしインボイス制度の導入により、適格請求書（インボイス）に税率ごとの消費税額や商品ごとの適用税率が明記されるようになり、正確な消費税の計算が可能になっています。

適格請求書（インボイス）の記載項目に従って処理することで、確定申告や仕入税額控除の手続きをより適切に進められるようになり、税額計算のミスや不正の防止にもつながります。

また、電子インボイス・デジタルインボイス（電子的に発行・受領する適格請求書）を活用すれば、複雑な税率計算もシステムが自動で処理するため、人為的ミスの削減と業務効率化が期待できるでしょう。

業務効率化

インボイス制度導入後、適格請求書の電子化（電子インボイス・デジタルインボイス）を進めることで、請求書や支払い管理の業務効率化が期待できます。

これまでは紙の請求書を会計システムに手入力していましたが、電子インボイス・デジタルインボイスなら電子データとして直接システムに取り込めるため、仕訳入力や入金消込の自動化も可能になります。

適格請求書（インボイス）は7年間の保管義務がありますが、電子データで管理すればクラウド上で保管できます。保管スペースやファイリングの手間とコストを削減でき、検索機能で必要な請求書も容易に探し出せるため、経理担当者の作業負担は大幅に軽減されるでしょう。また、場所に縛られる必要がないため、リモートワークによる作業も可能になります。

新しい取引先の獲得につながる機会

インボイス制度に対応すると、課税事業者である取引先は仕入税額控除を利用できるため、取引の継続や新規開拓に有利に働きます。免税事業者との取引では、買い手側は仕入税額控除が受けられず税負担が増えるため、適格請求書発行事業者が選ばれやすくなる傾向にあるからです。

インボイス制度対応事業者は、消費税処理の透明性と信頼性が高いと評価され、取引先からの信頼獲得につながります。特に新規取引の商談では、適格請求書発行事業者であることが取引開始の判断材料となるケースも増えており、ビジネスチャンスの拡大が期待できるでしょう。

インボイス制度の問題点への対応策

インボイス制度の問題点に対しては、適切な対応策を講じることで負担を軽減できる可能性があります。経理業務や業務フローの見直し、国が用意している特例や支援制度の活用、自社の状況に応じたしくみの構築など、段階的に取り組むことが重要です。

ここでは、実務に役立つ具体的な対応策について解説します。

経理・業務フローの見直し

インボイス制度導入により増加する経理・事務負担を軽減するには、業務フローの見直しが有効です。請求書発行から支払いまでの業務の流れを可視化し、無駄な作業や重複する確認作業を洗い出して、問題点を整理しながら、緊急性や重要度に応じた改善プランを実行しましょう。

また、現在使用している会計ソフトや請求書発行システムがインボイス制度に対応しているか確認し、必要に応じて改修や更新を行います。経理業務はルーティンワークが大部分を占めるため、一度の見直しで長期的に効率化のメリットを受けることができるでしょう。

制度上の特例や支援制度の活用

インボイス制度には、小規模事業者の負担を軽減するための特例や支援制度が設けられています。課税事業者が免税事業者から仕入れを行う際、一定期間は仕入税額の80％または50％の控除が認められる経過措置や、免税事業者から転換した事業者が納税額を売上消費税の20％に抑えられる「2割特例」などがあります。

これらの特例は申請が簡易であったり期間限定であったりするため、状況に応じて柔軟に活用できるよう理解しておくことが重要です。

自社に合ったしくみの検討

インボイス制度への対応には、請求書発行から記録・管理まで一連の業務を整理し、自社の規模や取引量に合ったしくみを構築することが大切です。現在使用している会計ソフトや請求書発行システムがインボイス制度に対応しているかを確認し、必要に応じて改修や更新を行いましょう。

適格請求書発行事業者と未登録事業者との取引を区別できるシステムを導入すると、正確な経理処理が可能になります。特に請求書発行数が多い企業では、紙での処理は印刷・封入・郵送などの作業に時間を取られるため、電子インボイス・デジタルインボイスへの移行も検討しましょう。

経理業務や支払い管理の効率化をサポート！三井住友カードの法人カード

フローの見直しや最適なしくみの構築などにより、インボイス制度への対策も進むでしょう。その際、大きく役立つのが法人カードです。経費精算システムへデータを連携できるため、入力ミスや改ざんを防ぎ、精査業務の効率化を助けます。

以下では、インボイス制度への対策や支払い管理の効率化といった経理業務をサポートする三井住友コーポレートカード、三井住友パーチェシングカードをご紹介します。

大企業におすすめ！三井住友コーポレートカード

カード使用者が多い大企業向けの法人カードです。出張費や交際費などを「会社全体」「部事業所別」「個人別」の3段階に分類し、経費予算管理を簡素化できます。また、旅行傷害保険が付帯されており、ゴールドカードでは全国の主要空港ラウンジをご利用いただけます。

オンライン決済におすすめ！三井住友パーチェシングカード

企業における仕入れやシステム利用料の支払いなど、企業の購買活動専用の法人カードで、特定の加盟店での決済に限定した利用ができます。
なお、三井住友パーチェシングカードは、プラスチックカードが発行されないため、紛失・盗難のリスクもありません。

インボイス制度の問題点に対策してメリットを受け取ろう

インボイス制度には経理負担の増加や免税事業者への影響などの問題点がある一方で、正確な税率の把握や業務効率化といったメリットもあります。特例制度や支援措置を活用しながら、業務フローの見直しや自社に合ったしくみを構築し、実務に活かしていきましょう。

よくある質問

Q1．インボイス制度の問題点は？

インボイス制度の主な問題点は、経理・事務負担の増加、免税事業者への影響、消費税負担の増加、価格・取引条件の不透明化、システム導入コストの負担、物価高騰への波及、情報公開によるリスクの7つです。特に、免税事業者は契約打ち切りや報酬減額など取引の維持に影響するため、早めの対策が必要です。

詳しくは以下をご覧ください。

インボイス制度の7つの問題点

Q2．インボイス制度のメリットは？

インボイス制度のメリットは、正しい税率を把握できる・業務効率化につながる・新しい取引先の獲得機会を得られるの3つです。また、適格請求書（インボイス）の電子化を進めることでクラウド上での保管が可能になり、リモートワークなどの柔軟な働き方もできるため、経理担当者の負担が大幅に軽減されます。

詳しくは以下をご覧ください。

インボイス制度のメリット

Q3．インボイス制度への対策は？

インボイス制度への対策として、経理・業務フローの見直し、制度上の特例や支援制度の活用、自社に合ったしくみの検討が重要です。業務の流れを可視化して無駄を削減し、2割特例や経過措置などの支援制度を活用することで負担を軽減できます。また、インボイス対応のシステム導入や電子化により、効率的な運用が可能になります。

詳しくは以下をご覧ください。

インボイス制度の問題点への対応策

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• ※2026年1月時点の情報のため、最新の情報ではない可能性があります。