仕入税額控除とは？要件やインボイス制度との関係をわかりやすく解説

仕入税額控除とは、消費税を算出する際に課税売上の消費税額から課税仕入れの消費税額を差し引くことを言います。

そもそも消費税は、商品の販売やサービスの提供などの取引に対して広く公平に課税される税金です。消費税は仕入れ、加工、流通といった各取引段階で発生するため、そのまま累積すると1つの商品・サービスに対して二重、三重に消費税が課されてしまいます。そこで、取引の各段階で課税が重複しないよう、仕入れに係る消費税額を控除する「仕入税額控除」という制度が設けられているのです。

仕入れ時に支払った消費税が200円、売上時に受け取った消費税が250円となっています。この場合、仕入れ時の消費税200円を控除対象とし、その差額である50円を納税します。このように仕入税額控除では、「課税売上げの消費税額」から「課税仕入れで納めた消費税額」を差し引くことで納付すべき消費税額を算出します。

具体的にどのようなケースで適用されるのかを解説していきます。

前々事業年度（個人事業主は前々年）における課税売上高が5,000万円以下で、事前に「消費税簡易課税制度選択届出書」を提出している事業者は、「簡易課税制度」を適用できます。

（出典）国税庁「No.6505　簡易課税制度」を参考に作成

国税庁ホームページ

簡易課税制度は、仕入税額控除の金額の算出に手間がかからない点が大きなメリットです。

簡易課税制度では、みなし仕入率を乗じて控除額を算出します。例えば、第2種事業者である小売業の課税仕入れが500万円だった場合、仕入税額控除の金額は「500万円 × 80％＝400万円」となります。

ほかの方式のように課税仕入れを区分したりする必要がないため、消費税の申告・納付に手間がかかりません。

簡易課税制度の適用を受けるためには、課税期間の初日の前日までに「消費税簡易課税制度選択届出書」を提出しておく必要があります。前もって手続きをしておかなければならないため、申告前になって簡易課税制度を希望することはできません。余裕をもって手続きをしましょう。

また、2種類以上の事業を営んでいる事業者で、課税売上げを事業ごとに区分していない場合は、一番低いみなし税率が適用されてしまいます。

課税売上高が5億円超または課税売上割合が95％未満の場合は、課税仕入れにかかった消費税額を以下の3つに区分します。

個別対応方式では、まず課税仕入れにかかった消費税額を以下の3つに区分します。
A．課税売上げにのみ要する課税仕入れなどに係るもの
B．非課税売上げにのみ要する課税仕入れなどに係るもの
C．課税売上げと非課税売上げに共通して要する課税仕入れなどに係るもの

個別対応方式は全額控除方式に比べて控除額の算出が複雑になりますが、課税売上の割合が高いほど控除額が大きくなるメリットがあります。

課税売上高が5億円超または課税売上割合が95％未満で個別対応方式を採用しない場合は、「一括比例配分方式」によって仕入税額控除の金額を算出します。

個別対応方式のように課税仕入れを区分できない場合や、上記計算式の方が控除額より大きくなる場合は、一括比例配分方式を採用するとよいでしょう。ただし、一括比例配分方式を選択した場合は、2年以上同じ方式を採用しなければならない点に注意が必要です。

課税売上高が5億円以下、かつ課税売上の割合が95％以上の場合は、課税仕入れにかかった消費税額を全額控除できます。

仕入税額控除の金額が最も大きくなる計算方式で、課税事業者の税負担を軽減する効果があります。また、課税仕入れにかかった消費税額をまとめて算出することから、控除額の計算に手間がかからない点も大きなメリットです。

仕入税額控除の対象になる取引と対象にならない取引には、明確な違いがあります。それぞれの具体例を確認しておきましょう。

課税仕入れは商品製造のために仕入れた原材料だけでなく、広告宣伝費や事務用品の購入、修繕費など、幅広いものが対象となります。

仕入税額控除の適用を受けるためには、定められた要件を記載した帳簿と適格請求書（インボイス））などの保存を行う必要があります。

仕入税額控除の適用要件は、「インボイス制度」の導入によって見直されており、その影響は消費税の免税事業者にも及んでいます。次の章で詳しく解説します。

2023年10月1日（日）から施行されたインボイス制度によって、仕入税額控除のルールも整備されました。それぞれのポイントを確認していきましょう。

なお、適格請求書（インボイス）の様式は法令などで定められておらず、上記の記載要件を満たしていれば手書きのものでも問題ありません。

適格簡易請求書では、以下5つの要件を記載することが必要です。

適格簡易請求書は適格請求書（インボイス）に比べて記載要件が簡略化されており、「書類の交付を受ける事業者の氏名または名称」を記載する必要がありません。また、様式については適格請求書（インボイス）と同様に法的な定めはなく、上記5つの記載要件を満たしていれば、手書きのものであっても適格簡易請求書として認められます。

インボイス制度では、免税事業者などインボイス発行事業者以外からの課税仕入れについては、仕入税額控除を受けることができません。

免税事業者が新たにインボイス発行事業者となった場合は、一定期間における仕入税額控除を売上げに係る消費税額の8割とすることができます。つまり消費税の税負担は2割となり、「インボイス発行事業者になったことによって大幅に税負担が増えた」ということを避けられるメリットがあります。

仕入税額控除の計算により、課税仕入れの消費税額が課税売上げの消費税額を上回った場合、その差額が消費税還付として返還される可能性があります。ただし、すべてのケースで還付が受けられるわけではありません。事業や取引内容によって異なるため、自社の状況を確認する必要があります。

• すべての赤字が還付になるわけではない
• 高額資産の購入は消費税還付につながる場合もある
• 輸出取引による消費税還付の可能性

事業が赤字になった場合は、収入よりも経費が多い状態であり、通常は受け取った消費税よりも支払った消費税が多くなります。これにより、課税仕入れ額が課税売上高を上回るため、還付申告により消費税還付を受けられる可能性があります。

ただし、給与や租税公課などの経費は消費税の対象とならないため、赤字の場合でも必ず消費税の還付が受けられるわけではありません。

建物や機械などの高額な設備投資を行った場合、支払う消費税額が大きくなるため、課税売上げに係る消費税額を上回り、消費税還付を受けられる可能性が高まります。ただし、土地や居住用賃貸建物の購入は消費税の対象となりません。また、非課税売上の割合が高い場合は全額還付を受けられないため注意が必要です。

当期の課税売上割合が95％以上かつ課税売上高が5億円以下であれば、支払った消費税額の全額控除が可能となります。なお、簡易課税制度では「みなし仕入率」により納付税額を計算するため、多額の設備投資など一般課税で計算すれば還付となる場合であっても、還付を受けることはできません。

輸出取引は消費税が免除されるため、輸出業を営む事業者の売上には消費税が発生しません。一方、国内での仕入れには消費税が発生するため、売上のほとんどが免税取引である場合、仕入れで支払った消費税の還付を受けられる可能性が高くなります。

ただし、輸出免税の適用を受けるには、輸出許可書などの証明書類を保存しておく必要があります。

課税事業者が課題として挙げているのが、消費税の税負担が大きくなる点です。

インボイス制度では、課税事業者が個人事業主などの免税事業者から仕入れを行う場合、仕入税額控除を受けられません。一定期間は経過措置により免税事業者からの課税仕入れも仕入税額控除の対象とされていますが、経過措置の終了後は課税事業者が消費税分を負担することになります。

そのため、個人事業主との取引が多い事業者では、税負担の増加が想定されています。

課税売上高が1,000万円以下の事業者については、「免税事業者」として消費税の納税が免除されています。そのため、小規模事業者やフリーランスなどの免税事業者は、インボイス制度導入後も特に変わりがないように感じられるかもしれません。

しかし、適格請求書（インボイス）を発行できない免税事業者は、取引先にとってみると「消費税の税負担が増える仕入れ先」となってしまいます。そのため、「適格請求書（インボイス）を発行してくれる事業者と取引しよう」と考える取引先が増えることも想定されます。

免税事業者は「課税事業者となって消費税を納める」か「免税事業者のまま取引先と交渉する」のどちらを選択するのかを、よく検討する必要があります。

経理業務の負担増加も軽視できない課題です。

インボイス制度の導入により、自社で発行する請求書への記載要件が増えたほか、取引先がインボイス発行事業者かどうかを確認したり、受け取った適格請求書（インボイス）の内容をチェックしたりといった業務が新たに発生しています。また、適格請求書（インボイス）を適切に保存する体制の整備も求められます。

こうした確認作業や書類管理の負担が増えたことで、インボイス制度への対応に時間を取られ、ほかの業務に影響が及ぶケースも見られます。

インボイス制度によって生じた業務負担増加の課題を解決するためには、制度に対応したシステムの活用が有効です。

前述のとおり、適格請求書（インボイス）は手書きのものでも問題ないとされていますが、記載要件を満たしていなければ再発行を求められるなど手間がかかることが想定されます。

インボイス制度に対応した請求書発行システムを導入すれば、法的要件を満たした適格請求書（インボイス）を手軽に作成することが可能です。そのほかにも、会計ソフトや受発注システムなどを導入する、インボイス制度対応にアップデートすることで、仕入税額控除に関する課題を解決できる期待があります。

なお、インボイス制度への対応のために導入したITツールについては、「IT導入補助金」の対象となる場合があります。ITツールを導入する際は、ぜひ補助金の活用も検討してみるとよいでしょう。

仕入税額控除を正しく適用するには、課税仕入れに係る経費を明確に管理することが重要です。特にインボイス制度の導入により、適格請求書（インボイス）の保存や経費データの整理が必須となったため、経理業務の負担が増大しています。

こうした課題を解決する手段として、法人カードの活用が効果的です。法人カードを導入することで、経費の支出状況をリアルタイムで把握でき、領収書や支出データがカード利用明細に集約されるため、経費精算の効率化が実現します。さらに、会計システムとの連携により、仕入税額控除の計算に必要なデータ管理がスムーズになります。

三井住友コーポレートカードを導入することにより、キャッシュレス化による小口現金の管理業務の削減、経費精算システムとの連携による入力業務の削減など、経理部門の業務を効率化することができます。また、任意で費目などの名義設定ができるので、仕訳作業が不要になります。加えて、経費精算システムからダウンロードしたCSVデータを取り込むことで、簡単に会計システムへ登録することができます。
さらに、三井住友カードでは「マンスリークリア方式」を採用しており、締め日翌日には利用枠がクリアされるため、予実管理が簡単なメリットがあります。

事業者が消費税を重複して納税することを避けるための仕入税額控除は、インボイス制度の開始によりいくつかの変更点が発生し、それらは発注側・受注側双方の課題となっています。

適切に仕入税額控除を受けるためには、インボイス制度に対応したシステムの導入やアップデートが必要でしょう。また、それらに加えて法人カードの活用を検討することも課題解決のひとつです。ぜひこの機会に経理業務のデジタル化に取り組んでみてはいかがでしょうか。

仕入税額控除とは、課税事業者が消費税を重複して納付することを防ぐための制度で、「課税売上げの消費税額」から「課税仕入れで納めた消費税額」を差し引いて、納付すべき消費税額を算出します。

仕入税額控除は、「簡易課税制度」「個別対応方式」「一括比例配分方式」「全額控除方式」の4種類の中からいずれかを選択して算出します。

インボイス制度導入により、仕入税額控除を受けるには適格請求書発行事業者から交付された適格請求書（インボイス）の保存が必要となりました。適格請求書（インボイス）には登録番号、取引年月日と内容、税率ごとの対価額など6つの記載事項が求められます。なお、免税事業者など適格請求書発行事業者以外からの課税仕入れは原則控除対象となりませんが、制度開始後の混乱を避けるため、一定期間は経過措置により控除が認められています。